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基于強連通分量的13C_MFA計算模型穩(wěn)定性判斷 Estimating Stability of 13C MFA Calculating Model Through the Concept of Strong Connected Component |
| 作者： 周宏;鄭浩然;李毅;李恒 |
| 單位：中國科學技術(shù)大學計算機科學技術(shù)系,合肥,230027 |
| 關鍵詞： 代謝流量分析%碳同位素標記實驗%陷阱%有向圖%強連通分量 |
| 分類號： |
| 出版年·卷·期（頁碼）：2009·28·1（34-38） |
| 摘要： |
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基于碳同位素標記實驗的代謝通量分析,是代謝工程中一種強大的定量分析工具.13C MFA在進行定量分析時,需要給定代謝網(wǎng)絡及其對應的碳原子轉(zhuǎn)移網(wǎng)絡,同時為了保證計算的正確性和可靠性,要求所給定的碳原子轉(zhuǎn)移網(wǎng)絡中不能含有陷阱(trap).本文基于有向圖中強連通分量的概念,給出了trap的一種形式化定義,并利用一種基于深度優(yōu)先搜索的圖論算法,實現(xiàn)了對trap的自動檢測.實驗結(jié)果表明,該算法能夠得到正確可靠的結(jié)果. |
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