北京生物醫(yī)學(xué)工程

基于形狀分布的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性比較方法

3D protein structure similarity comparison using shape distributions

作者：周穎;張樹(shù)生;李悍

單位：西北工業(yè)大學(xué)現(xiàn)代設(shè)計(jì)與集成制造技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,西安,710072

關(guān)鍵詞：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析%特征提取%形狀分布曲線%函數(shù)距離

分類號(hào)：

出版年·卷·期（頁(yè)碼）：2008·27·4（389-392）

摘要：

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比較是計(jì)算生物學(xué)中最重要的問(wèn)題之一,并且在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)中發(fā)揮著重要作用.本文提出一種基于形狀分布的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性比較方法,進(jìn)行兩種蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的一致性比較.該方法完全不依賴于序列信息.對(duì)PDB蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)驗(yàn)證的結(jié)果表明,本文所使用的方法可以作為任意結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)相似性比較的有效輔助手段.對(duì)不具備序列相似性的蛋白質(zhì)分子之間的相似性比較具有現(xiàn)實(shí)意義.

參考文獻(xiàn)：

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