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基于多特征融合的蛋白質(zhì)折疊子預(yù)測(cè) Protein Fold Prediction Based on Multi-Feature Fusion |
| 作者： 施建宇;潘泉;張紹武;邵壯超;姜濤 |
| 單位：西北工業(yè)大學(xué)自動(dòng)化學(xué)院,西安,710072%西北工業(yè)大學(xué)自動(dòng)化學(xué)院,西安,710072;西北工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)院,西安,710072 |
| 關(guān)鍵詞： 折疊子預(yù)測(cè)%多特征融合%支持向量機(jī)%多類分類 |
| 分類號(hào)： |
| 出版年·卷·期（頁碼）：2006·25·5（482-485） |
| 摘要： |
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蛋白質(zhì)折疊子預(yù)測(cè)為啟發(fā)式搜索蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)提供了有用的信息.目前已知的折疊子預(yù)測(cè)方法大多數(shù)基于單種特征或多種特征的簡(jiǎn)單組合,本文采用一種多特征融合方法,從蛋白質(zhì)的一級(jí)序列出發(fā),對(duì)27類折疊子進(jìn)行預(yù)測(cè).使用支持向量機(jī)作為分類器,采用多對(duì)多的多類分類策略,以氨基酸組成成分、極性、極化性、范德瓦爾斯量、疏水性和預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)作為樣本的六種特征,進(jìn)行多特征融合,獨(dú)立樣本預(yù)測(cè)總精度為59.22%,與Ding等人的結(jié)果比較提高了3.2%,結(jié)果表明多特征融合方法是一種有效的蛋白質(zhì)折疊子預(yù)測(cè)方法. |
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| 參考文獻(xiàn)： |
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