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蛋白亞細(xì)胞定位的預(yù)測(cè)方法研究

A Study of Prediction Methods for Protein Subcellular Localization

作者: 王明會(huì);李驁;謝丹;馮煥清 
單位:中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)電子科技系,合肥,230026
關(guān)鍵詞: 亞細(xì)胞定位%位置特異性打分矩陣%模糊k近鄰%支持向量機(jī)%生物信息學(xué) 
分類號(hào):
出版年·卷·期(頁(yè)碼):2006·25·6(649-653)
摘要:

預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位信息對(duì)于了解其功能有重要的意義.選擇氨基酸組成、氨基酸對(duì)組成、位置特異性打分矩陣三種分類特征以及模糊k近鄰、支持向量機(jī)兩種預(yù)測(cè)方法,分別進(jìn)行了測(cè)試.對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果的分析顯示,位置特異性打分矩陣可以提高對(duì)不同亞細(xì)胞器的可區(qū)分性;而支持向量機(jī)可以更好地利用位置特刎異性打分矩陣特征進(jìn)行預(yù)測(cè).使用氨基酸組成和位置特異性打分矩陣兩種特征,并結(jié)合支持向量機(jī),是一種有效的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)方法.

參考文獻(xiàn):

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