北京生物醫(yī)學工程

RNA二級結(jié)構(gòu)在siRNA設(shè)計中的應(yīng)用

Application of RNA secondary structure in siRNA design

作者：桂堅斌孫迎高武

單位：上海理工大學醫(yī)療器械與食品學院(上海200093)

關(guān)鍵詞： RNA干擾；二級結(jié)構(gòu)；siRNA；沉默效率

分類號：

出版年·卷·期（頁碼）：2012·31·6（652-656）

摘要：

RNA干擾（RNA interference，RNAi）是一種基因沉默現(xiàn)象，通過短雙鏈RNA（small interfering
RNA，siRNA）降解靶基因的信使RNA（message RNA，mRNA）以抑制基因的表達。在RNAi的應(yīng)用中，設(shè)計高
效的siRNA對RNAi的成功有重要作用。關(guān)于siRNA的設(shè)計已有很多設(shè)計原則可供參考，如MPI準則、Tuschl
法則等。在此基礎(chǔ)上，亦有研究進一步考察了RNA二級結(jié)構(gòu)對siRNA沉默效率的影響，并建立相關(guān)模型進行
分析，如氫鍵系數(shù)、排斥環(huán)模型等。本文就RNA二級結(jié)構(gòu)在siRNA設(shè)計過程中模型的建立及結(jié)論的驗證做出
論述與分析。

RNA interference (RNAi) is a kind of gene silencing. Small interfering RNA
(siRNA) is used to suppress gene expression by degrading the message RNA (mRNA) of the
target gene. Effective siRNAs are important in RNAi experiments. There are a lot of
principles for siRNA design，such as MPI basic principles and Tuschl principles and so on.
On the basis of these studies，some have made further research on the relationship between
RNA secondary structure and silencing efficiency of siRNA，and several models have been
established，such as H-b index，spelling loops and so on. In this paper，we discuss and
analyze the studies of RNA secondary structure in siRNA design.

參考文獻：

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