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基于壓縮感知預(yù)測(cè)凋亡蛋白亞細(xì)胞位點(diǎn) Prediction of apoptosis protein subcellular location based on compressive sensing |
| 作者： 石雪娜 王瑞平 |
| 單位： 北京交通大學(xué)計(jì)算機(jī)與信息技術(shù)學(xué)院（北京100044） |
| 關(guān)鍵詞： 凋亡蛋白；亞細(xì)胞位點(diǎn)；壓縮感 |
| 分類(lèi)號(hào)： |
| 出版年·卷·期（頁(yè)碼）：2015·34·1（70-71） |
| 摘要： |
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目的 蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞位點(diǎn)信息有助于了解蛋白質(zhì)的功能，同時(shí)還可以 為新藥物的研發(fā)提供幫助。 方法 在本研究中，采用壓縮感知算法對(duì)凋亡蛋白 的亞細(xì)胞位點(diǎn)進(jìn)行分類(lèi)。 結(jié)果 經(jīng)過(guò)在2個(gè)常用的數(shù)據(jù)集上使用Jackknife測(cè)試 ，在ZD98數(shù)據(jù)集上取得了90.6%的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率，在ZW225數(shù)據(jù)集上取得了87.3%的 準(zhǔn)確率。 結(jié)論 實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明壓縮感知算法對(duì)已凋亡蛋白的亞細(xì)胞定位研究效 果良好，且避免了特征提取的過(guò)程。 |
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Objective The information of protein subcellular location helps us to understand protein function and to design new drugs. Methods In this paper, compressive sensing algorithm is adopted to classify protein subcellular location. Results By Jackknife test on datasets, our overall accuracies for ZD98 and ZW225 are 90.6% and 87.3% respectively. Conclusions The effect of compressive sensing algorithm is significant to classify apoptosis protein subcellular location. And compressive sensing can avoid the process of feature extraction. |
| 參考文獻(xiàn)： |
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